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動(dòng)力學(xué)停流和雙梳光譜法在中紅外光譜區(qū)的應(yīng)用
  • 發(fā)布時(shí)間 : 2021-06-22 10:50:51
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  1.介紹
  蛋白質(zhì)化學(xué)家一直希望在中紅外區(qū)(mid-IR)跟蹤蛋白質(zhì)的折疊動(dòng)力學(xué),以便更好地了解蛋白質(zhì)的折疊過程,并獲得折疊過程中二級(jí)結(jié)構(gòu)變化的信息。傳統(tǒng)上,動(dòng)力學(xué)停流裝置是耦合到傅里葉變換紅外(FTIR)光譜儀。盡管FT-IR技術(shù)的進(jìn)步和步進(jìn)掃描采集的使用,這種快速動(dòng)力學(xué)裝置的主要限制通常是FT-IR光譜儀的時(shí)間分辨率。最快的采集速度通常在30-50 ms范圍內(nèi)(甚至更長(zhǎng)),因此它與Bio-Logic SFM的幾毫秒死時(shí)間(使用FTIR池)不匹配。實(shí)際上,這些光譜儀是為穩(wěn)態(tài)研究應(yīng)用而設(shè)計(jì)的,干涉儀的使用限制了數(shù)據(jù)采集的速度。因此,用這種技術(shù)不可能觀察到短于100-200ms的快速動(dòng)力學(xué)過程。

  一些自制的紅外探測(cè)系統(tǒng)已在實(shí)驗(yàn)室中開發(fā)1,以達(dá)到這種采集速度并獲得毫秒分辨率,但到目前為止,還沒有一個(gè)商業(yè)化。

  圖1 SFM-4000與IRis-F1(IRsweep)連接。


  性能參數(shù):
  ·5ms死時(shí)間
  ·75-100 μl每次注射樣品體積
  ·臍帶容積200μl
  ·單、雙、三混
  · 100 μm至500μm光程
  ·紅外光譜4μs采集時(shí)間
  ·0.3cm-1分辨率下1000光譜/秒連續(xù)反應(yīng)監(jiān)測(cè)
  ·10-3 AU單次注射的噪聲水平
  另一個(gè)限制是分光計(jì)的信噪比,因?yàn)樗c采集速度直接相關(guān)。具有更快采集速度的商用FT-IR光譜儀通常需要對(duì)多次停流曲線進(jìn)行平均,以提高信噪比,這在紅外區(qū)域內(nèi)需要處理珍貴或濃縮樣品時(shí)會(huì)出現(xiàn)問題。
  為了克服傅立葉變換紅外光譜儀的采集速度和靈敏度問題,IRsweep2公司研制了一種基于雙梳光譜的新型紅外光譜儀。IRsweep公司的IRis-F1光譜儀是一種雙梳光譜儀,專為快速動(dòng)力學(xué)測(cè)量而設(shè)計(jì)。本應(yīng)用說明的目的是說明如何將Bio-Logic SFM與IRsweep IRis-F1連接起來,以毫秒時(shí)間標(biāo)度跟蹤反應(yīng),并觀察之前沒有見過的中紅外反應(yīng)現(xiàn)象。
  1.什么是雙梳光譜?
  雙梳狀光譜儀的原理與傳統(tǒng)的傅里葉變換或色散光譜儀完全不同。兩個(gè)緊密匹配的激光源發(fā)射的寬帶紅外光束(頻率梳)通過樣品后疊加在單個(gè)探測(cè)器元件上。檢測(cè)到的光的波長(zhǎng)是根據(jù)在探測(cè)器上觀察到的射頻信號(hào)的頻率來解析的。由于不需要運(yùn)動(dòng)部件,一次實(shí)驗(yàn)只需4微秒就能記錄到完整的紅外光譜。因此,如本應(yīng)用說明所示,通過停流技術(shù)研究的毫秒反應(yīng)動(dòng)力學(xué)可以很容易地遵循在優(yōu)越信噪比下的紅外光譜特征?;诟吖β始す庠?,雙梳光譜儀還具有高亮度,允許在強(qiáng)吸收溶劑中進(jìn)行高光譜和時(shí)間分辨率的測(cè)量。
  2.實(shí)驗(yàn)裝置
  本應(yīng)用筆記中使用了SFM-4000和IRis-F1光譜儀(見圖1)。SFM-4000有3個(gè)混合器和4個(gè)注射器,由獨(dú)立的步進(jìn)電機(jī)驅(qū)動(dòng),使用戶可以完全控制體積、注射速度和混合比。SFM的FTIR附件與Iris-F1樣品室完全兼容。
  流通池使用CaF2窗口,用戶可以通過改變窗戶之間的間隔物在100μm至500μm自由改變光程。在本應(yīng)用筆記中,安裝的是100μm光程,對(duì)應(yīng)是15μl的死體積(從最后一個(gè)混合器到流通池中心)。因此,使用3ml/s的流速,對(duì)應(yīng)的死時(shí)間為5ms。最后一個(gè)混合器直接集成到FT-IR附件中,以最小化死體積。
  SFM-4000主體通過臍帶連接器連接到FT-IR流動(dòng)池,臍帶將來自混合器2出口和注射器4的溶液輸送到最后一個(gè)混合器,進(jìn)入最終混合階段。通過硬截止閥與停止電機(jī)的同步來確保液流的瞬時(shí)停止。停止流量推送和IRis-F1之間的同步是使用5V TTL觸發(fā)器實(shí)現(xiàn)的。
  3.β-乳球蛋白結(jié)構(gòu)改變
  β-乳球蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)在用三氟乙醇作為變性劑中從β-折疊到α-螺旋的快速轉(zhuǎn)變由Gerwert等人描述4。這種快速反應(yīng)用于演示SFM-4000和IRis-F1耦合的性能。
  二級(jí)結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)變是通過1:1的比例混合濃度25mg/ml的在10%三氟乙醇/20 mM DCl的重水中的β- 乳球蛋白,與60%三氟乙醇/20 mM DCl的重水中(見圖2),導(dǎo)致三氟乙醇的濃度變化從10%V到35%V。

  圖2用于β- 乳球蛋白反應(yīng)的混合序列

  用氘化水和鹽酸來避免H2O在1650cm-1處的強(qiáng)背景吸收。實(shí)驗(yàn)采用每種溶液100μl和3 ml/s的總速度注入,導(dǎo)致5 ms的死時(shí)間。
  以每次4μs連續(xù)采集130毫秒得到光譜。對(duì)應(yīng)于反應(yīng)初始狀態(tài)的預(yù)觸發(fā)光譜被用作吸收光譜的背景。在后處理中,光譜在1ms內(nèi)進(jìn)行共平均,光譜以3cm-1進(jìn)行平均。

  圖3 反應(yīng)的前10ms獲得的紅外光譜??梢姷倪B續(xù)偏移。
  圖3顯示了前10 ms測(cè)量的紅外光譜的演變,1635 cm-1和1660 cm-1處的譜帶證實(shí)了快速中間體的存在,如Gerwert等人所觀察到的。


  圖4 β-乳球蛋白結(jié)構(gòu)改變:DA時(shí)間痕跡, 4次停流注射的平均
  圖4顯示了通過減去1623 cm-1處的吸光度校正基線漂移后4次停流實(shí)驗(yàn)的平均值。反應(yīng)在約100ms內(nèi)完成,但在10ms以下的早期可以獲得非常明確的信號(hào)。
  1.結(jié)論
  使用標(biāo)準(zhǔn)FT-IR和臍帶連接器附件,Bio-Logic SFM可以很容易地耦合到Iris-F1雙梳光譜儀。使得小于10ms的生化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)可以在中紅外區(qū)進(jìn)行研究,而傳統(tǒng)的紅外光譜實(shí)驗(yàn)是受限的。
  利用IRis-F1,在10-3 AU(吸光度單位)下以1ms的時(shí)間分辨率獲得單次停流注射的吸光度譜。共同平均多次注射或降低時(shí)間分辨率,靈敏度可以進(jìn)一步提高。
  所述實(shí)驗(yàn)僅使用的SFM-4000兩個(gè)注射器,但如果用戶希望編程自動(dòng)濃度研究或雙重混合實(shí)驗(yàn),則可以使用額外的兩個(gè)注射器,在這種情況下,使用一條臍帶線作為延遲線來老化第一次混合。SFM-2000和SFM-3000也可以與IRis-F1光譜儀耦合。
  參考文獻(xiàn):
  1) J. Tang, F. Gai, A Millisecond Infrared Stopped-Flow Apparatus. Applied Spectroscopy. 2006; 60(12) ; 1477-1481.
  2) A. Hugi, G. Villares, S. Blaser, H.C. Liu, J. Faist, Mid-infrared frequency comb based on a quantum cascade laser. Nature 492, 229–233 (2012).
  3) https://irsweep.com/technology/
  4) Kauffmann, E., Gerwert, K. et al. (2001). PNAS, 98(12), 6646–6649

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